סביר להניח שלפחות חמישה כלי נשק יפנים מסורתיים שונים, אך כיוון שהסמוראים נלחמו והיו פעילים במהלך תקופות ארוכות בהיסטוריה היפנית, בחלק מהתקופות היו יותר מלחמות וחלק אחר היה יותר דו-קרב שהתבסס על לחימה בחרב עיקר (מה שהיום נקרא איאיידו ו-קנג'יטסו).
סמוראי יפני לרוב ידע להשתמש בכלי נשק הבאים:
+ חרב יפנית (קטאנה, וחרב תרגול – בוקן)
+ מקל (באורכים שונים)
+ חנית
+ חץ וקשת
+ שוריקן (נשק הטלה)
בנוסף היו נשקים נוספים שידעו סמוראים שונים כמו נגמאקי, שרשראות עם סכינים וחלקים חדים, נגינאטה ועוד.
